Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FARSBQ9NSD9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FARSBQ9NSD9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms