Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELLSQ9NRZ9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELLSQ9NRZ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELLSQ9NRZ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELLSQ9NRZ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELLSQ9NRZ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELLSQ9NRZ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HELLSQ9NRZ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELLSQ9NRZ9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELLSQ9NRZ9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms