Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDR39U1Q9NRG7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SDR39U1Q9NRG7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms