Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT4

EXOSC5, Exosome complex component RRP46, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.025e-10■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.085e-10■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-213ENST00000526842 535 ntTSL 513.87□□□□□ -0.195e-10■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-221ENST00000534372 544 ntTSL 58.45□□□□□ -1.065e-10■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-219ENST00000531291 572 ntTSL 56.25□□□□□ -1.415e-10■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-216ENST00000528968 587 ntTSL 55.77□□□□□ -1.495e-10■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-217ENST00000529361 555 ntTSL 55.58□□□□□ -1.525e-10■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-220ENST00000532325 526 ntTSL 54.25□□□□□ -1.735e-10■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-202ENST00000399614 594 ntTSL 44.08□□□□□ -1.765e-10■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 NAP1L4-204ENST00000448187 888 ntTSL 53.44□□□□□ -1.865e-10■■■■■ 29
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-208ENST00000476899 788 ntTSL 515.56■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-214ENST00000496268 1039 ntTSL 37.87□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RSRC1-209ENST00000477788 755 ntTSL 35.8□□□□□ -1.481e-6■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RBM33-209ENST00000440108 1027 ntTSL 513.95□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RBM33-210ENST00000486747 559 ntTSL 313.22□□□□□ -0.298e-8■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RBM33-206ENST00000392761 2934 ntTSL 212.07□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RBM33-202ENST00000307403 4360 ntTSL 29.3□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 ALOX12-AS1-205ENST00000572385 576 ntTSL 410.55□□□□□ -0.725e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 ALOX12-AS1-209ENST00000575889 439 ntTSL 3 BASIC9.37□□□□□ -0.915e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 ALOX12-AS1-203ENST00000570562 567 ntTSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.985e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.43e-6■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.343e-6■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 CDK13-206ENST00000611390 2222 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RBSN-205ENST00000449964 1132 ntTSL 515.54■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RBSN-209ENST00000507357 582 ntTSL 414.37□□□□□ -0.112e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RBSN-203ENST00000441057 1352 ntTSL 513.7□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.882e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 PIP4K2A-203ENST00000422321 768 ntTSL 37.86□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.081e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 PPIL4-201ENST00000253329 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 GLCCI1-202ENST00000414914 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.62□□□□□ -0.393e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 GLCCI1-203ENST00000430798 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 312.6□□□□□ -0.393e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 GLCCI1-212ENST00000496617 538 ntTSL 59.28□□□□□ -0.923e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 GLCCI1-209ENST00000489405 1475 ntTSL 56.53□□□□□ -1.363e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 GLCCI1-204ENST00000438949 873 ntTSL 35.29□□□□□ -1.563e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 GLCCI1-207ENST00000474269 691 ntTSL 54.62□□□□□ -1.673e-7■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.314e-8■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.464e-8■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-209ENST00000445654 522 ntTSL 311.9□□□□□ -0.54e-8■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-203ENST00000409161 9208 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.594e-8■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.654e-8■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-211ENST00000449833 8850 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.684e-8■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.684e-8■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-205ENST00000412252 1376 ntTSL 59.66□□□□□ -0.864e-8■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 SHANK2-208ENST00000426687 460 ntTSL 57.98□□□□□ -1.134e-8■■■■■ 28.9
EXOSC5Q9NQT4 FGF13-203ENST00000421460 352 ntTSL 1 (best)5.81□□□□□ -1.488e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 PRKCB-210ENST00000498739 569 ntTSL 413.51□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC00470-211ENST00000584492 1281 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.936e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC00470-203ENST00000577867 1211 ntTSL 1 (best)8.56□□□□□ -1.046e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC00470-204ENST00000578835 674 ntTSL 27.24□□□□□ -1.256e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC00470-206ENST00000581212 721 ntTSL 1 (best)4.56□□□□□ -1.686e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC00470-209ENST00000582862 424 ntTSL 1 (best)3.82□□□□□ -1.86e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 LINC00470-202ENST00000577403 251 ntTSL 1 (best)2.87□□□□□ -1.956e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.962e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.972e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF107-202ENST00000360117 1061 ntTSL 1 (best)7.08□□□□□ -1.289e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF107-206ENST00000620827 5685 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.49e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.429e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.619e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 PRELID2-205ENST00000510259 525 ntTSL 32.4□□□□□ -2.038e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-211ENST00000520610 1120 ntTSL 511.72□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-206ENST00000518329 812 ntTSL 211.64□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-218ENST00000522461 575 ntTSL 411.35□□□□□ -0.592e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-217ENST00000521737 559 ntTSL 511.09□□□□□ -0.632e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-220ENST00000522608 769 ntTSL 510.64□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-204ENST00000407272 1947 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-224ENST00000524064 819 ntTSL 510.12□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-210ENST00000519407 598 ntTSL 310.01□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-215ENST00000521503 446 ntTSL 410.01□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-209ENST00000519286 965 ntTSL 59.15□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-205ENST00000517392 2771 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-219ENST00000522490 861 ntTSL 37.77□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-207ENST00000518853 813 ntTSL 37.72□□□□□ -1.172e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-202ENST00000368968 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.272e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-222ENST00000523209 866 ntTSL 57.07□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-214ENST00000521277 3832 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.32e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.882e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-212ENST00000520761 865 ntTSL 53.29□□□□□ -1.882e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.932e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.022e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.252e-6■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.699e-7■■■■■ 28.8
EXOSC5Q9NQT4 WDR70-207ENST00000511906 5716 ntTSL 25.37□□□□□ -1.559e-7■■■■■ 28.8
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