Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYLDQ9NQC7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CYLDQ9NQC7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
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