Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCSER2Q9H7U1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CCSER2Q9H7U1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
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