Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SMYD3Q9H7B4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMYD3Q9H7B4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMYD3Q9H7B4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms