Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6R3

ACSS3, Acyl-CoA synthetase short-chain family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS3Q9H6R3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ACSS3Q9H6R3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACSS3Q9H6R3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSS3Q9H6R3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms