Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTIF3Q9H2K0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTIF3Q9H2K0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms