Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C2

ARV1, Protein ARV1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARV1Q9H2C2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ARV1Q9H2C2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARV1Q9H2C2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARV1Q9H2C2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARV1Q9H2C2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms