Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NIF3L1Q9GZT8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NIF3L1Q9GZT8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NIF3L1Q9GZT8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms