Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
POLR1EQ9GZS1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
POLR1EQ9GZS1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
POLR1EQ9GZS1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms