Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC39A8Q9C0K1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC39A8Q9C0K1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC39A8Q9C0K1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms