Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC13A1Q9BZW2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC13A1Q9BZW2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms