Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC4A5Q9BY07 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC4A5Q9BY07 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC4A5Q9BY07 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms