Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KIFC3Q9BVG8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KIFC3Q9BVG8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KIFC3Q9BVG8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms