Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAAF1Q9BRP4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PAAF1Q9BRP4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAAF1Q9BRP4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.3 ms