Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSF3RQ99062 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSF3RQ99062 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms