Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CAMKK2Q96RR4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CAMKK2Q96RR4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CAMKK2Q96RR4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms