Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRNT1Q96Q11 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TRNT1Q96Q11 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TRNT1Q96Q11 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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