Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPGRIP1Q96KN7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPGRIP1Q96KN7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPGRIP1Q96KN7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms