Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM8Q96KF7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM8Q96KF7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms