Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHAMP1Q96JM3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHAMP1Q96JM3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAMP1Q96JM3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms