Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGAP3Q96FM1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAP3Q96FM1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAP3Q96FM1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms