Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GRAMD1AQ96CP6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GRAMD1AQ96CP6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GRAMD1AQ96CP6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms