Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ERCC4Q92889 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERCC4Q92889 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERCC4Q92889 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms