Protein–RNA interactions for Protein: Q92611

EDEM1, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM1Q92611 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EDEM1Q92611 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EDEM1Q92611 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms