Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCTD4Q8WVF5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCTD4Q8WVF5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms