Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDF6

RASGRP4, RAS guanyl-releasing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRP4Q8TDF6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RASGRP4Q8TDF6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RASGRP4Q8TDF6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RASGRP4Q8TDF6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms