Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TTLL11Q8NHH1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TTLL11Q8NHH1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TTLL11Q8NHH1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms