Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF548Q8NEK5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF548Q8NEK5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms