Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 28.2
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AGGF1Q8N302 GET4-206ENST00000464468 676 ntTSL 317.02■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 28.2
AGGF1Q8N302 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 216.96■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 28.2
AGGF1Q8N302 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 28.2
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AGGF1Q8N302 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-11■■■■■ 28.2
AGGF1Q8N302 FAM208B-206ENST00000477043 514 ntTSL 216.02■□□□□ 0.162e-11■■■■■ 28.2
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AGGF1Q8N302 FAM208B-208ENST00000482419 424 ntTSL 26.95□□□□□ -1.32e-11■■■■■ 28.2
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AGGF1Q8N302 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.076e-7■■■■■ 28.1
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AGGF1Q8N302 PPP2R1B-206ENST00000527614 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.993e-9■■■■■ 28.1
AGGF1Q8N302 ATP10A-206ENST00000555815 6766 ntTSL 521.82■■□□□ 1.081e-7■■■■■ 28.1
AGGF1Q8N302 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.521e-7■■■■■ 28.1
AGGF1Q8N302 PLOD1-204ENST00000449038 762 ntTSL 516.34■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 28.1
AGGF1Q8N302 PLOD1-203ENST00000429000 886 ntTSL 515.53■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 28.1
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AGGF1Q8N302 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.911e-9■■■■■ 27.9
AGGF1Q8N302 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.771e-9■■■■■ 27.9
AGGF1Q8N302 UBE2K-202ENST00000438068 2262 ntTSL 219.82■□□□□ 0.761e-9■■■■■ 27.9
AGGF1Q8N302 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.621e-9■■■■■ 27.9
AGGF1Q8N302 UBE2K-206ENST00000510934 589 ntTSL 218.72■□□□□ 0.591e-9■■■■■ 27.9
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AGGF1Q8N302 MIB1-204ENST00000578646 3306 ntTSL 211.55□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 27.8
AGGF1Q8N302 MED13L-203ENST00000548743 568 ntTSL 37.44□□□□□ -1.223e-8■■■■■ 27.8
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AGGF1Q8N302 PRDM15-202ENST00000398548 6654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.662e-6■■■■■ 27.8
AGGF1Q8N302 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 27.8
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AGGF1Q8N302 OGG1-212ENST00000426518 874 ntTSL 515.65■□□□□ 0.14e-8■■■■■ 27.7
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AGGF1Q8N302 AC027808.2-202ENST00000561295 459 ntTSL 33.68□□□□□ -1.826e-8■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 PRKAR1B-202ENST00000400758 888 ntTSL 324.59■■□□□ 1.531e-7■■■■■ 27.7
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AGGF1Q8N302 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 27.7
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AGGF1Q8N302 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.111e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 27.7
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AGGF1Q8N302 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.071e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 FXYD6-203ENST00000524841 571 ntTSL 414.51□□□□□ -0.091e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 ZEB2-230ENST00000629955 1435 ntTSL 514.22□□□□□ -0.131e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.141e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 FXYD6-212ENST00000540359 656 ntTSL 213.06□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 FXYD6-213ENST00000579486 532 ntTSL 412.59□□□□□ -0.391e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 TMEM164-202ENST00000372068 5566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 DSCAS-201ENST00000581836 553 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 27.7
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AGGF1Q8N302 PPP1R7-217ENST00000485630 828 ntTSL 37.86□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 TMEM164-205ENST00000461715 711 ntTSL 36.88□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 27.7
AGGF1Q8N302 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.289e-7■■■■■ 27.6
AGGF1Q8N302 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.449e-7■■■■■ 27.6
AGGF1Q8N302 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 221.24■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 27.5
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