Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC170Q8IYT3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC170Q8IYT3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC170Q8IYT3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms