Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LMNTD2Q8IXW0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMNTD2Q8IXW0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMNTD2Q8IXW0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms