Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG4Q86SJ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DSG4Q86SJ6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DSG4Q86SJ6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DSG4Q86SJ6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms