Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4F1

LRP10, Low-density lipoprotein receptor-related protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP10Q7Z4F1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRP10Q7Z4F1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRP10Q7Z4F1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRP10Q7Z4F1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LRP10Q7Z4F1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRP10Q7Z4F1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRP10Q7Z4F1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRP10Q7Z4F1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
LRP10Q7Z4F1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRP10Q7Z4F1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRP10Q7Z4F1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRP10Q7Z4F1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRP10Q7Z4F1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms