Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT3

SSX9, Protein SSX9, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX9Q7RTT3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SSX9Q7RTT3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SSX9Q7RTT3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms