Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX8Q6ZV50 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RFX8Q6ZV50 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX8Q6ZV50 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms