Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDHR3Q6ZTQ4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDHR3Q6ZTQ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms