Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RFLNAQ6ZTI6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RFLNAQ6ZTI6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RFLNAQ6ZTI6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms