Protein–RNA interactions for Protein: Q6QAJ8

TMEM220, Transmembrane protein 220, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM220Q6QAJ8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM220Q6QAJ8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM220Q6QAJ8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM220Q6QAJ8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms