Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFWD3Q6PCD5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFWD3Q6PCD5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFWD3Q6PCD5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms