Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HMBOX1Q6NT76 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMBOX1Q6NT76 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMBOX1Q6NT76 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms