Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
INTS3Q68E01 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
INTS3Q68E01 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INTS3Q68E01 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms