Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTUD1Q5VV17 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
OTUD1Q5VV17 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTUD1Q5VV17 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms