Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWT1Q5T5J6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SWT1Q5T5J6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SWT1Q5T5J6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SWT1Q5T5J6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SWT1Q5T5J6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWT1Q5T5J6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWT1Q5T5J6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWT1Q5T5J6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SWT1Q5T5J6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms