Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPECC1Q5M775 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPECC1Q5M775 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms