Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TDRD12Q587J7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD12Q587J7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms