Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COBLL1Q53SF7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COBLL1Q53SF7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COBLL1Q53SF7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms