Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC39A12Q504Y0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC39A12Q504Y0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms